RNA分析软件汇总

2016-07-18 生物软件网浙江省生物信息学学会
RNA draw 1.1 b2RNA draw 1.1b2 RNA二级结构分析软件。
RNAstructure 5.7Unix平台软件mfold的java版本。
RnaViz 2.0界面友好的RNA二级结构图绘制程序。可生成发表质量的二级结构图，可显示一些特殊结构。
loopDloop 2.07bJava语言写成的绘制RNA二级结构的软件，需要安装JAVA虚拟机。
Circles 0.1.1使用比较的方法分析RNA二级结构软件，并以标准格式输出预测的二级结构。
SStructView 1.2用JAVA脚本语言写成的RNA二级结构显示软件。
Vienna RNA Package 2.1.9维也纳大学RNA二级结构预测与比较软件包。
XRNA 1.2.0b基于java的生成、显示、注释RNA二级结构的软件，可很容易地编辑、修改、生成发表质量的RNA二级结构图。
PseudoViewer 3.0RNA二级结构显示软件。
OligoEngine 2.0RNAi设计软件。
pknotsRG 1.3预测RNA二级结构软件，包括pseudoknots（假扭结）结构。
RNAshapes 2.1.6分析RNA二级结构软件。
miRanda 201008查找基因组中潜在的RNA位点软件。软件运行需要安装JAVA运行环境。
RNAz 2.1预测结构保守热稳定RNA结构，可用于基因组中筛查功能RNA结构等等。
RnaFamilyjava编写的用于显示一个RNA分子族的所有二级结构小软件。
RNApasta 1.01Java语言所写的比对和结构注释RNA序列统计分析工具。
RnaDv 1_0RNA二级结构显示软件
Assemble2 1.2构建和研究RNA结构的图形软件
VARNA 3-93RNA二级结构显示插件
nocoRNAc 1.23非编码RNA鉴定软件
RnallViewer 1.0.1RNA分析显示软件
在线工具
siDirect 2.0siRNA在线设计软件。
tRNAscan-SE 1.21在基因组数据中寻找tRNA基因的在线工具。

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