PCR相关软件汇总

2016-07-25 生物软件网浙江省生物信息学学会
NoePrimer 3.0独特的引物设计软件
Primer Premier 6.23 DEMO序列分析与引物设计，非常棒的一个软件。
Oligo 7.60 Demo引物设计分析著名软件，主要应用于核酸序列引物分析设计软件。
Primer D'Signer 1.1免费的引物设计辅助软件，专门用于pASK-IBA和pPR-IBA表达载体，简化引物设计工作。
Array Designer 4.43 DemoDNA微阵列（microarray）软件，批量设计DNA和寡核苷酸引物工具。
Beacon Designer 8.14 Demo实时荧光定量PCR分子信标(Molecular beacon )及TaqMan探针设计软件。 
NetPrimerJAVA语言写成的免费引物设计软件，用IE打开运行。
e-PCR 2.3.12电子克隆是一种电脑软件，用来识别DNA序列标签位点（STSs)。
FastPCR 6.5.55快速设计各种类型PCR引物，还包括一些常用的DNA与蛋白序列软件工具；
PerlPrimer 1.1.21一个免费的用来设计引物的开源软件。
AmplifX 1.7.0设计与管理引物的软件。
AutoDimer 1.0快速筛选二聚体引物软件。
ORFprimer 1.6.4.1JAVA语言设计的引物设计软件
Primer Prim'er 5.6.0Flash制作的PCR引物设计软件。
PCR Analyzer 1.02实时RT-PCR反应中估算初始扩增子浓度软件
PCRTiler 1.42Tiled和Specific PCR引物设计软件
PrimerFactoryQt 1.0.3引物查找和设计软件
在线工具
DNAWorks 3.0是一个帮助进行基因合成的设计寡核苷酸序列的免费程序。 程序仅需要输入一些简单的信息，比如，目标蛋白的氨基酸序列及合成核酸序列的温度。程序输出的为适合所选择生物表达的优化密码子的核酸序列。利用DNAWorks的帮助，用两步PCR法，可以成功合成长度达到3000碱基对的基因。原始网站。
Primer 3比较有名的在线引物设计程序。
Primo Pro 3.4在线PCR引物设计java系列软件。
SGD Web Primer在线引物设计软件。
AutoPrime快速设计真核表达实时定量PCR引物在线软件。

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