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【轉貼】區塊鏈將加速醫學領域發展 預計五年內將被用於基因數據儲存

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區塊鏈將加速醫學領域發展 預計五年內將被用於基因數據儲存 （原标题：分布式账本中的生命科学） 生物科学是医学领域涉及遗传研究，疾病预防和生活方式治疗（lifestyle treatments）的学科。它已经存在了很长时间，但区块链技术的基础设施应用给该学科提供了重大进步的可能性。 根据Pistoia Alliance进行的2016年6月份高级制药和生命科学领袖调查，83％的受访者表示，他们预计在五年内将全面采用区块链技术。 Pistoia Alliance是一个全球性的非营利组织，致力于降低生命科学研究与开发创新的障碍。该联盟旨在加强生命科学行业与其他互补部门利益相关者之间的合作，以支持区块链倡议和合作关系。 基因数据的隐私和安全 基因组学或一般的生命科学是研究处理敏感和个人的数据，安全和隐私一直是生物科学行业的主要关注点。Anthem数据泄露事件是数据安全和重要性的公开例子之一。 为了解决其隐私和安全威胁，利益相关方开始合作开展全行业的数据共享标准，以改善沟通，并确保患者能安心的与公司共享数据。预计这方面的努力将有利于研究人员和患者，不管是短期还是长期而言。 个人数据的存储和安全仍然是行业重点。这个重点在基因组学，测序和祖传史方面尤其重要。越来越多的寻求新的医疗发现和治疗方法，生命科学公司和临床研究机构正在寻求获取这些有价值的数据。事实上，在一个关键的发现中，Pistoia Alliance已经得出结论，基因组数据，可以说是世界上数据增长最快的数据，可以有效地存储在区块链上。 尽管区块链给了数据存储解决方案的巨大希望，但在生物科学行业广泛应用仍然存在许多障碍。在上述调查中，例如，尽管绝大多数受访者期望更广泛地采用区块链技术，但仍然存在疑虑。一些受访者表示，监管问题是扩大行业使用区块链解决方案（45％）的最大障碍，其次是数据隐私问题（26％）。许多行业领导者似乎认为，只有通过合作努力超越这些障碍并设法安全地存放和分享敏感数据，区块链的价值主张才能实现。 分布式账本技术的生命科学先驱 Genecoin正在创造一种革命性的服务，可通过比特币网络上传，备份个人DNA序列。 Encrypgen创建了一个基于区块链的解决方案，称为Gene-Chain，帮助实验室和医疗保健提供者从任何样品中存储和管理基因组...
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PCR相关软件汇总 2016-07-25   生物软件网 浙江省生物信息学学会 NoePrimer 3.0 独特的引物设计软件 Primer Premier 6.23 DEMO 序列分析与引物设计，非常棒的一个软件。 Oligo 7.60 Demo 引物设计分析著名软件，主要应用于核酸序列引物分析设计软件。 Primer D'Signer 1.1 免费的引物设计辅助软件，专门用于pASK-IBA和pPR-IBA表达载体，简化引物设计工作。 Array Designer 4.43 Demo DNA微阵列（microarray）软件，批量设计DNA和寡核苷酸引物工具。 Beacon Designer 8.14 Demo 实时荧光定量PCR分子信标(Molecular beacon )及TaqMan探针设计软件。   NetPrimer JAVA语言写成的免费引物设计软件，用IE打开运行。 e-PCR 2.3.12 电子克隆是一种电脑软件，用来识别DNA序列标签位点（STSs)。 FastPCR 6.5.55 快速设计各种类型PCR引物，还包括一些常用的DNA与蛋白序列软件工具； PerlPrimer 1.1.21 一个免费的用来设计引物的开源软件。 AmplifX 1.7.0 设计与管理引物的软件。 AutoDimer 1.0 快速筛选二聚体引物软件。 ORFprimer 1.6.4.1 JAVA语言设计的引物设计软件 Primer Prim'er 5.6.0 Flash制作的PCR引物设计软件。 PCR Analyzer 1.02 实时RT-PCR反应中估算初始扩增子浓度软件 PCRTiler 1.42 Tiled和Specific PCR引物设计软件 PrimerFactoryQt 1.0.3 引物查找和设计软件 在线工具 DNAWorks 3.0 是一个帮助进行基因合成的设计寡核苷酸序列的免费程序。 程序仅需要输入一些简单的信息，比如，目标蛋白的氨基酸序列及合成核酸序列的温度。程序输出的为适合所选择生物表达的优化密码子的核酸序列。利用DNAWorks的帮助，用两步PCR法，可以成功合成长度达到3000碱基对的基因。原始网站。 Primer 3 比较有名的在线引物设计程序。 Primo Pro...
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RNA分析软件汇总 2016-07-18   生物软件网 浙江省生物信息学学会 RNA draw 1.1 b2 RNA draw 1.1b2 RNA二级结构分析软件。 RNAstructure 5.7 Unix平台软件mfold的java版本。 RnaViz 2.0 界面友好的RNA二级结构图绘制程序。可生成发表质量的二级结构图，可显示一些特殊结构。 loopDloop 2.07b Java语言写成的绘制RNA二级结构的软件，需要安装JAVA虚拟机。 Circles 0.1.1 使用比较的方法分析RNA二级结构软件，并以标准格式输出预测的二级结构。 SStructView 1.2 用JAVA脚本语言写成的RNA二级结构显示软件。 Vienna RNA Package 2.1.9 维也纳大学RNA二级结构预测与比较软件包。 XRNA 1.2.0b 基于java的生成、显示、注释RNA二级结构的软件，可很容易地编辑、修改、生成发表质量的RNA二级结构图。 PseudoViewer 3.0 RNA二级结构显示软件。 OligoEngine 2.0 RNAi设计软件。 pknotsRG 1.3 预测RNA二级结构软件，包括pseudoknots（假扭结）结构。 RNAshapes 2.1.6 分析RNA二级结构软件。 miRanda 201008 查找基因组中潜在的RNA位点软件。软件运行需要安装JAVA运行环境。 RNAz 2.1 预测结构保守热稳定RNA结构，可用于基因组中筛查功能RNA结构等等。 RnaFamily java编写的用于显示一个RNA分子族的所有二级结构小软件。 RNApasta 1.01 Java语言所写的比对和结构注释RNA序列统计分析工具。 RnaDv 1_0 RNA二级结构显示软件 Assemble2 1.2 构建和研究RNA结构的图形软件 VARNA 3-93 RNA二级结构显示插件 nocoRNAc 1.23 非编码RNA鉴定软件 RnallViewer 1.0.1 RNA分析显示软件 在线工具 siDirect 2.0 siRNA在线设计软件。 tRNAscan-SE 1.21 在基因组数据中寻找tRNA基因的在线工具。
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Nature反思：人类“有性”生殖的终结，皮肤造人要颠覆自然吗？（胚胎,生殖,皮肤,女性,父母,体外受精,基因） 标题:   Nature反思：人类“有性”生殖的终结，皮肤造人要颠覆自然吗？（胚胎,生殖,皮肤,女性,父母,体外受精,基因） 摘要:   地球上几乎所有的动植物繁衍均离不开性生活，然而，随着科技的进步，人类脱离性生活的生殖繁衍成为了可能。近年来，关于利用皮肤细胞制造精子卵子从而繁殖后代的报道已不再罕见。然而，传统的繁衍方式真的要被颠覆了吗？科技最终能抵得过现实吗？4月7日，发表在《Nature》杂志上的文章对人类生殖的未来进行了反思。1性的终结与人类生殖的未来2016年，美国斯坦福大学遗传伦理学家Henry Greely撰写了《T…… 地球上几乎所有的动植物繁衍均离不开性生活，然而，随着科技的进步，人类脱离性生活的生殖繁衍成为了可能。近年来，关于利用皮肤细胞制造精子卵子从而繁殖后代的报道已不再罕见。然而，传统的繁衍方式真的要被颠覆了吗？科技最终能抵得过现实吗？4月7日，发表在《Nature》杂志上的文章对人类生殖的未来进行了反思。 性的终结与人类生殖的未来 2016年，美国斯坦福大学遗传伦理学家Henry Greely撰写了《The End of Sex and the Future of Human Reproduction》（性的终结及人类生殖的未来）一书，并由哈弗大学出版社出版了。 作者Henry Greely拥有一份令人羡慕的工作——解释当前生育及遗传技术的科学基础和法律规定。这本书聚焦在新技术的发展—— “轻松”PGD（Easy PGD）。Greely设想女性不用接受激素疗法，将卵子取出用于胚胎创建，并能进行胚胎检测；相反，可通过干细胞技术将女性的皮肤细胞诱导成卵子，随后将这些卵子与其丈夫的精子进行受精，可创造出多达100个胚胎。在这种情况下，通过全基因组测序，父母可选择最好的胚胎植入女性的子宫内。 此外，3月28日，英国《每日邮报》以《Will designer babies end the need for sex? Humans could reproduce using skin samples within 20 years, cla...
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生物专业的软件介绍

生物专业的软件介绍 三维分子类             RASMOL 2.7.5 观看生物分子 3D 微观立体结构的软件。 RasTop 2.2 为 RasMol 的图形用户界面软件，免费，简化 RASMOL 的使用。 DS Visualizer 3.0 3 维分子浏览工具， 30 天试用版， 功能也十分强大。 ICM-Browser 3.7 2a 3 维分子浏览工具，并具有序列比对显示功能，免费推出。 ActiveICM 1.1.4 可在 Office 软件和浏览器中显示查看三维 ICM 分子图片文件软件。 VMD 1.9 用来显示生物分子的微观立体结构，更棒的功能是可以利用内建的功能，做出动画效果。 CN3D 4.1 See in 3D 的缩写。允许你在线作为客户端可视并交互地观察 NCBI Entrez 数据库的立体蛋白序列。 WPDB 2.2 美国国家计算机科学与工程学实验室开发的基于 Windows 的 PDB 文件查询与处理分析软件。 DTMM 4.2 Demo 是一个简单易用的 3 维分子模型显示、编辑与构建程序。 gopenmol 3.0 是一个显示并分析分子结构及其特性，计算分子轨道、电子势的软件包。 POV-Ray 3.7b38 是一个高质量、完全免费创造最棒三维图像的非常有名的工具。 MegaPov 1.2.1 r3  是 Pov-Ray 非官方编译版本，三维渲染效果更好。需要安装 Pov-Ray 。 Mol2Mol 5.6.2 Demo 主要用来进行各种分子文件的转换，支持 30 种主要分子格式，也可以用来进行 3 维分子的简单显示。 MolPOV 2.0.8 MolPOV 是 PDB 格式至 POV 格式转化工具。 PovChem...
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